Административно-судебные реформы 1867-1868 гг. были проведены не сразу, из-за восстаний их введение длилось свыше 20 лет. В 1886 г. было принято «Положение об управлении Туркестанским краем», а в 1891 г. «Положение об управлении Акмолинской, Семипалатинской, Семиреченской, Уральской и Тургайской областями». В Туркестанском крае были созданы три области: Сырдарьинская, Ферганская и Самаркандская.
Центром управления краем был г. Ташкент. По «Положению» 1891 г., Акмолинская, Семипалатинская и Семиреченская области были подчинены Степному генерал-губернаторству, Главное управление которого находилось в Омске. Генерал-губернатор наделялся неограниченной властью. Военные губернаторы назначались и увольнялись по представлению министра внутренних дел, по согласию с военным министром. Областные правления Казахстана были приравнены к губернскому правлению центральных районов империи.
В Семиреченской и Уральской областях военные губернаторы являлись наказными атаманами казачьих войск. В крупных областных центрах (Верный, Уральск, Петропавловск, Семипалатинск) были созданы городские полицейские управления, а в уездных городах — городские приставства, которые подчинялись уездным начальникам. Военный губернатор мог утвердить или не утвердить выборы волостного управителя. А министр внутренних дел мог «в исключительных случаях» разрешать замещение должностей волостных управителей без выборов. Таким образом, выборные начала приобрели формальный характер. Поэтому аульные старшины утверждались уездным начальником. Судебные преобразования, начатые в виде опыта в 1867-1868 гг., были закреплены актами 1886-1891 гг. В Туркестанском крае были созданы суда имперского типа Низшим судебным звеном был «народный суд», который рассматривал дела коренного мусульманского населения. Для рассмотрения дел, касающихся жителей разных уездов и волостей, по распоряжению военного губернатора созывалась чрезвычайные съезды судей.